Dès 1807 la communauté qui est devenu plus tard Napoleonville était connu sous le nom de "canal". Ce canal prolongé à l'ouest par le lac Verret.

La ville a été nommée par un soldat qui a servi sous Napoléon Bonaparte.

Les premiers règlements permanents dans cette région ont été faites par les français et lesespagnols vers le milieu du 18e siècle le long de Bayou Lafourche, entre les villes de Donaldsonville et de Napoleonville.

De 1755 à 1764, la population a augmenté grâce à l'immigration des Acadiens exilés du Canada, et qui ont pénétré dans la zone centre des terres et ont construit des maisons confortables.

La ville a été officiellement constituée le 11 mars 1878.